Saturs

• Programmatūras pārskats
• Atbalstītie failu tipi
• Galvenais faila paplašinājums
• Citi failu paplašinājumi, ko izmanto integrētais genoma pārlūks 9

Versija (no 6/29/2016)	9
Platformas
Licence	Atvērtais avots
Kategorija	Zinātniskā

Papildinformācija (apmeklējiet izdevēja vietni)

Vērtējums: 2.8 / 5 (6 balsis)

Programmatūras pārskats

Galvenās iezīmes

• Atbalsta dažādus genoma formātus, piemēram, GenBank un FASTA
• Mijiedarbojas ar datiem ar tālummaiņas un panorāmas animācijām
• Piekļūstiet un ielādējiet genomus no QuickLoad vietnēm
• Pārveidojiet datus dažādās diagrammas formās
• Koplietojiet datus ar līdzstrādniekiem, izmantojot Dropbox
• Papildu funkcionalitātei instalējiet spraudņus

Integrētā genoma pārlūkprogramma (IGB) ir atvērtā koda programma, ko izmanto, lai apskatītu un izpētītu lielas genoma datu kopas. Varat apskatīt dažādus datu formātus, mijiedarboties ar datiem, izveidot diagrammas, saglabāt informāciju kā attēlus un koplietot datus ar līdzstrādniekiem.

IGB ļauj apskatīt datus no anotācijām un saskaņotām sekvencēm. Programma atbalsta dažādus formātus, piemēram, FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband un GenBank. Jūs varat veikt datus un pārveidot tos par dažādām diagrammas formām, tostarp nesakritības diagrammām, lai izceltu datu atšķirības un dziļuma diagrammas, lai parādītu pārklājumu. Varat arī sazināties ar saviem datiem, izmantojot IGB tālummaiņas un panorāmas animācijas.

IGB ļauj piekļūt un ielādēt genomus no QuickLoad vietnēm, kas ir vienkāršas direktoriju, secību un citu datu failu sistēmas vizualizācijas nolūkiem. IGB nodrošina papildu funkcionalitāti ar spraudņu atbalstu, lai pievienotu funkcionalitāti un darbplūsmas automatizāciju, izmantojot skriptus. IGB arī sniedz jums uzlabotas funkcijas, lai koplietotu datus, neatkarīgi no tā, vai tas tiek publicēts kā augstas kvalitātes JPEG, PNG vai SVG attēls vai saglabāti dati Dropbox, lai jūsu sadarbības partneri varētu piekļūt jūsu projektam.

IGB galvenokārt izmanto universitāšu pētnieki, biologi un bioinformātikas speciālisti. Tā nodrošina uzlabotus rīkus, lai atvērtu dažādus genoma datu formātus, vizualizētu datus kā dažādus grafikus un koplietotu datus ar līdzstrādniekiem. Diemžēl programma balstās uz dotācijām nepārtrauktai attīstībai, kas nozīmē, ka atbalsts pieteikumam var tikt pārtraukts jebkurā laikā. Tomēr integrētā genoma pārlūkprogramma joprojām ir spējīga, pielāgojama programma lietotājiem, kas vēlas izpētīt un analizēt savus genoma datus.

Atbalstītie failu tipi

Galvenais faila paplašinājums

.XML - XML ​​fails

Citi failu paplašinājumi, ko izmanto integrētais genoma pārlūks 9

Atbalstītie failu tipi
.BED	UCSC BED anotācijas ceļa fails
.DAS	DeltaMaster analīzes sesija
.FA	FASTA formatēts secības fails
.FAS	FASTA secības fails
.FASTA	FASTA secības fails
.GB	GenBank datu fails
.SGR	SGR genoma datu fails
.USEQ	USeq genoma datu fails